تذخر المكتبة العامة بالمعهد بالعديد من المراجع والكتب والدوريات والرسائل الجامعية والبحوث والأوراق العلمية في مختلف المعارف خاصة مجالات عمل المنظمة والمعهد مثل الدعوة والتدريب والإسلام في القارة السمراء ويؤمها الباحثين وطلاب الدراسات العليا.

يحرص المشرفون على المكتبة على تزويدها بأحدث الاصدارات خاصة من المعارض الدولية مثل معرض الخرطوم الدولي للكتاب ومعرض القاهرة وغيرها .

وتستقبل المكتبة العامة زوارها يومياً اثناء ساعات العمل الرسمية.